Orthopoxvirus, osoitus
| 15392 | -PoxPAK |
Osatutkimukset
-PoxNhO, -PoxVi ja -VirEm
Tiedustelut
Virologian ja immunologian laboratorio, Virologian nukleiinihappotutkimukset, p.050 427 2128
Yhteyshenkilöt
sairaalamikrobiologi Hannimari Kallio-Kokko: hannimari.kallio-kokko
hus.fi / 050 427 0476, sairaalamikrobiologi Laura Mannonen: laura.mannonenhus.fi / 040 838 4009 ja lääkäri Satu Kurkela: satu.kurkelahus.fi / 050 428 4183
Lähete
Indikaatiot
Kliininen epäily orthopoxvirusinfektiosta (lähinnä lehmärokko). Infektiohälytystilanteet (apinarokkoepäily tai isorokkoepäily). Parapoxvirusinfektiota epäiltäessä (esim. Orf-virusten aiheuttama infektio ihmisellä) myös pyyntö -ZoonNhO, 20857.
Näyteastia
Katso kohta "Näyte" (Weblab Clinicalissa "Näytteen käs.ohjeet")
Näyte
Rikotun rakkulan pohjalta tai leesiosta otetaan näyte steriilillä dacron- tai nailontikulla viruskuljetusputkeen (esim. Copan UTM) tai vaihtoehtoisesti tehdaspuhtaaseen, kierrekorkilliseen muoviputkeen, jossa n. 1-1,5 ml steriiliä keittosuolaliuosta. Kudospala (muutaman mm3:n pala) laitetaan kierrekorkilliseen muoviputkeen pieneen määrään steriiliä fysiologista keittosuolaliuosta tai viruskuljetusputkeen. Kudospalan voi toimittaa myös steriiliin fysiologiseen keittosuolaan kostutetussa sideharsotaitoksessa, joka on suljettu tehdaspuhtaaseen kierrekorkilliseen muoviseen näyteastiaan.
Menetelmä
Tutkimuspaketti. Nukleiinihapon osoitus PCR-tekniikalla. Virusviljely. Elektronimikroskopia (EM). Orthopoxvirusten tai parapoxvirusten tyypitys tehdään sekvenoinnin avulla. Apinarokkovirukselle käytössä spesifi PCR-testi. Laboratorio valitsee kulloinkin diagnoosiin tarvittavat menetelmät, ensisijaisesti tehdään vain nukleiinihapon osoitus.
Tekotiheys
Tarpeen mukaan
Tulokset valmiina
Alustava tulos elektronimikroskopiasta 1-2 työpäivän aikana; viljelystä ja PCR:stä 3-5 työpäivän aikana; tarkempi tyypitys 1-2 viikon kuluessa näytteen saapumisesta.
Tulkinta
Poxvirus-DNA:n löytyminen näytteestä suoraan on diagnostinen löydös.
Huomautuksia
Huom. infektiohälytystilanteessa (apinarokko- tai isorokkoepäilyssä) on aina jo ennen näytteenottoa otettava yhteys tutkivaan laboratorioon (HUSLAB, Virologia)! Yhteydenotot virka-aikaan: Virologian nukleiinihappotutkimukset p. 050 427 2127. Yhteydenotot virka-ajan ulkopuolella: Päivystävä laboratoriohoitaja p. 040 837 4010 tai 040 837 4011
Apinarokkoepäilynäytteet voidaan lähettää kategoria B kuljetuksena, isorokkoepäilynäytteet vaativat kategoria A kuljetuksen. Infektiohälytysnäytteitä sisältävien pakettien päälle kirjataan selkeästi merkintä "Infektiohälytys - POX-epäily".
Lisäksi suositellaan samanaikaista seeruminäytettä, josta tehdään orthopoxvirus IgM- ja IgG-vasta-ainemääritykset, ks. S-Orthopoxvirus, vasta-aineet (pyyntö S-PoxAb, KL 4609).
Parapoxvirusinfektiota (esim. Orf-virus) epäiltäessä tilataan -POXPAK-tutkimuksen lisäksi myös -ZoonNhO-tutkimus (20857), tätä tutkimusta tilattaessa on otettava ennakkoon yhteys tutkivaan laboratorioon.
Tutkimus -PoxPAK päivitetty 04.08.2022 / SK
Viimeisin päivitys: 13.08.2022 klo 01:26.