Tutkimusohjekirjan etusivu. Hakemisto erikoisalan, nimen, lyhenteen tai tutkimusnumeron mukaan
Vertaileva genominen hybridisaatio -mikrolevytesti, kudosnäytteestä
| 8263 | Ts-VGH-ML |
Tiedustelut
Genetiikan laboratorio 050 428 6393, 050 427 9184.
Yhteyshenkilöt
sairaalageneetikko Tarja Salonen: tarja.salonen
hus.fi / 0504286393 ja sairaalageneetikko Kirsi Autio: kirsi.autiohus.fi / 0504279184
Indikaatiot
Erotusdiagnostinen tutkimus kiinteissä kasvaimissa (esim. sarkoomat ja aivotuumorit). Lisäksi tutkimusta käytetään kromosomitutkimuksia täydentävänä tutkimuksena hematologisissa maligniteeteissa (leukemiat ja lymfoomat).
Näyte
NÄYTE: Tuumorikoepala ravintonesteessä tai suolaliuoksessa. Voidaan tehdä myös parafiinileikemateriaalista, 10-20 kpl noin 10 mikrometrin paksuista leikettä kuivaan putkeen otettuna. Näytteen tulee sisältää yli 50% tuumorikudosta.
Näytteen mukaan liitetään laboratorion lähete "Lähete Kromosomi-/DNA-/RNA-tutkimusta varten", jonka saa HUSLABin nettisivuilta osoitteesta
http://huslab.fi/ohjekirjan_liitteet/lahetteet
Lähetys: Meilahden alueella otettu näyte lähetetään välittömästi genetiikan laboratorioon. Kauempaa tulevat näytteet pakataan huolellisesti ja lähetetään pika- tai ykköspostissa osoitteeseen: HUSLAB, genetiikan laboratorio, Haartmaninkatu 2, 6. krs, 00290 Helsinki
Menetelmä
DNA-eristys, DNA:n leimaaminen ja hybridisoiminen kaupalliselle 244.000 oligonukleotidin mikrosirulle. Geenien kopiomäärän lukeminen laserskannerilla ja analysointi tietokoneohjelmalla.
Tekotiheys
Joka toinen viikko
Tulokset valmiina
Kuukauden kuluessa
Tulkinta
DNA:n kopiomäärän lisääntymisten (esim. kromosomien tai kromosomialueiden trisomioiden, duplikaatioiden, korkea-asteisten monistumien) ja puutosten (kromosomien tai kromosomialueiden monosomioiden ja deleetioiden) osoittaminen jopa yksittäisen geenin tarkkuudella. Tasapainossa olevia kromosomien ja geenien uudelleenjärjestymiä menetelmä ei paljasta. Jotta poikkeavuus voidaan nähdä, tulee näytteessä olla poikkeavia soluja ainakin puolet (50%) kaikista soluista. Tutkimuksesta annetaan kirjallinen lausunto.
Huomautuksia
Tutkimusta kutsutaan myös molekyylikaryotyypitykseksi tai CGH-array-tutkimukseksi.
Päivitetty 16.01.2012 / MP