Tutkimusohjekirjan etusivu. Hakemisto erikoisalan, nimen, lyhenteen tai tutkimusnumeron mukaan
Fragiili-X DNA tutkimus kudosnäytteestä
| 4306 | Ts-FraX-D |
Tiedustelut
Genetiikan laboratorio, puh. 09 471 74339 toimisto tai 09 471 75905 lääkäri tai molgenlab(at)hus.fi
Yhteyshenkilöt
sairaalageneetikko Maaret Ridanpää: molgenlab
hus.fi / (09) 471 74927 / 050 428 7258 ja sairaalageneetikko Kirsi Piippo: kirsi.piippohus.fi / 050 427 9544
Lähete
Näyte
Näyte toimitetaan osoitteella HUSLAB, Genetiikan laboratorio , Naistenklinikka, C-siipi, 5. krs, 00290 Helsinki.
Menetelmä
Fragmenttianalyysi. Akkreditoitu menetelmä.
Tulokset valmiina
Kahden kuukauden kuluessa näytteen saapumisesta.
Yleistä
FraX-oireyhtymä (MIM 309550) on tavallisin henkisen kehitysvammaisuuden perinnöllinen syy. FraX-oireyhtymä oli ensimmäinen tauti, jossa todettiin dynaaminen trinukleotiditoistojakson (CGG)n mutaatio. FraX-geeni, FMR1, koostuu 17 eksonista ja kattaa noin 38 kiloemäsparia alueella Xq27.3. Ensimmäisen eksonin 5'-päässä proteiinia koodaavan alueen ulkopuolella on CGG-toistoalue, jossa kaksivaiheinen mutaatio tapahtuu. (CGG)n-toistojaksojen määrä vaihtelee normaaliväestössäkin eli toistojakso on polymorfinen. Normaalin alleelin toistojen lukumäärä voi olla 6-60 ja alleeli on stabiili sekä mitoosissa että meioosissa. Esi- eli premutaatio tekee alueen meioosissa epästabiiliksi, mikä johtaa toistojen lisääntymiseen. Epästabiileiksi premutaatioiksi on todettu kooltaan 46-200 toistojakson mittaiset alleelit. Täten 46-60 toistojaksoa on harmaa alue, jossa pelkkä toistojen määrä ei paljasta mutaatiota. Toistojen lukumäärän ollessa yli 200 promoottorialueen CpG- saareke hypermetyloituu, geeni inaktivoituu eikä transkriptiota ja translaatiota tapahdu. Tämän täysmutaation tulos on suuri (CGG)n -toistojakso, joka on epästabiili sekä mitoosissa että meioosissa.
Tulkinta
FRAXA-lokuksen FMR1-geenin ensimmäisen exonin CGG- toistojaksoalueen toistojen lukumäärä on joko normaali, harmaalla alueella, epästabiililla esimutaatioalueella tai täysmutaatioalueella. Täysmutaatiota kantavilla pojilla/ miehillä on FraX-oireyhtymä ja tytöillä/naisilla fenotyyppi on vaihteleva.
Huomautuksia
Kiireellisestä tutkimuksesta (tulos viiden arkipäivän sisällä) on ilmoitettava etukäteen laboratorioon ja kiireellisyys on merkittävä selvästi lähetteeseen. Tutkimuksesta peritään kiireellisyyslisä. Jatkotutkimuksia ei tehdä kiireellisinä ilman erillistä pyyntöä.
Päivitetty 05.12.2011 / MR