Tutkimusohjekirjan etusivu. Hakemisto erikoisalan, nimen, lyhenteen tai tutkimusnumeron mukaan

Bakteeri, erikoisviljely, verestä

20847

B -BaktVIP

Tiedustelut

Bakteriologian osasto, puh. (09) 191 26253 tai 75816

Yhteyshenkilöt

lääkäri Juha Kirveskari: juha.kirveskarihus.fi / 09 19126838 / 050 4279573, mikrobiologi Eveliina Tarkka: eveliina.tarkkahus.fi / (09) 191 26285 / 050 427 2496 ja lääkäri Päivi Tissari: paivi.tissarihus.fi / (09) 191 26295 / 050 427 0737

Indikaatiot

Sepsiksen tai meningiitin epäily, erityisesti vastustuskyvyltään heikentyneillä potilailla.

Esivalmistelu

Noudatettava tarkkaa aseptiikkaa.

Näyteastia

Bactalert aerobi- ja anaerobipullot

Näyte

Yleensä kaksi n. 15-60 min. välein otettua veriviljelypulloparia on riittävä määrä. Kiireellisessä tapauksessa näytteet voi ottaa samanaikaisesti molemmista kyynärtaipeista. Endokardiittiepäilyssä suositellaan neljää veriviljelynäytettä. Käynnissä oleva mikrobilääkehoito ei ole este veriviljelyn ottamiselle. Näytteenottokohdan iho puhdistetaan erityisen huolellisesti esim. klooriheksidiinispriillä kontaminaatioiden välttämiseksi.

Näyte otetaan siipi-/vakuumineulalla tai 20 ml:n kertakäyttöruiskulla. Huoneenlämpöisen veriviljelypullon muovinen korkki poistetaan ja alla oleva kuminen korkki desinfioidaan. Jos veri lasketaan suoraan letkua pitkin veriviljelypulloon, täytetään ensin aerobipullo, sen jälkeen anaerobipullo. Ruiskusta veri lasketaan ensin anaerobipulloon, sen jälkeen aerobipulloon. Näin vältetään ilman joutuminen anaerobipulloon. Vakuumia ei oteta loppuun.

Aikuiset: 8-10 ml (max 10 ml) kumpaankin pulloon, lapset: an-pullo 5-8 ml, lasten aer-pullo 1-4 ml.

Menetelmä

Viljely, tunnistaminen DNA-tekniikalla ja biokemiallisilla testeillä sekä herkkyysmääritys. Menetelmään kuuluu rikastusviljely veriviljelypullossa aerobi- ja anaerobiatmosfääreissä. Positiivisesta näytteestä mikrobit tunnistetaan DNA-tekniikoilla, mikä mahdollistaa tavanomaisimpien löydösten identifikaation viljelymenetelmiä nopeammin. Kaikista näytteistä tehdään lisäksi perinteinen viljely, jossa löydökset tunnistetaan biokemiallisesti ja niiden mikrobilääkeherkkyys määritetään.

PCR-testi tunnistaa seuraavat bakteerilajit: gramnegatiiviset: E.coli, Kl.pneumoniae, Kl.oxytoca, Proteus mirabilis, Proteus vulgaris, Enterob.aerogenes, Enterob. cloacae, Salmonella enterica ssp enterica (mm. S.Typhi ja S. Paratyphi), Serratia marcescens. Acinetob.baumannii, Pseud. aeruginosa, Stenotrophomonas maltophilia, Campylobacter jejuni/coli, Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis, apatogeeniset neisseriat, Bacteroides fragilis-ryhmä. Lisäksi Enterobacteriaceae-heimon tasolla tunnistuvat ainakin seuraavat lajit: Citrob. freundii, C. koseri, C. amalonaticus, C. braakii, Enterob. sakazakii, Ent. hormaechei, Kluyvera intermedia, Morganella morganii, Pantoea agglomerans, Providencia rettgeri, Prov. stuartii, Yers.enterocolitica ja Yers.pseudotuberculosis (lajeja ei erotella).

grampositiiviset: Staph.aureus, Staph.epidermidis, mecA- geeni, koag.neg. stafylokokki (ainakin S.lugdunensis, S. haemolyticus, S.saprophyticus, S.hominis, S.capitis, S. warneri, S.xylosus), Enteroc.faecalis, Ent.faecium Str. pyogenes (A), Str.agalactiae (B), Str.dysgalactiae ssp equisimilis (G/C), Str.pneumoniae, Listeria monocytogenes, Clostridium perfringens

Tekotiheys

Viljely joka päivä, PCR-testi arkipäivinä.

Tulkinta

Normaalisti negatiivinen. Mikäli löydöstä pidetään kontaminanttina, se mainitaan.

Huomautuksia

Potilaan työdiagnoosi on syytä mainita lähetetiedoissa. Vaikka tutkimus tehdään molekyylibiologisin menetelmin, voi antibioottihoito aiheuttaa viiveen tuloksen valmistumisessa vai väärän negatiivisen tuloksen, koska tutkimus edellyttää bakteerien rikastumista veriviljelypullossa.

PCR-testi ei tunnista hiivoja eikä muita sieniä, eikä myöskään viridans-ryhmän streptokokkeja, jotka ovat melko tavallisia hematologisilla potilailla ja endokardiitin aiheuttajina. Nämä, samoin kuin muut testillä tunnistumattomat mikrobit, tunnistetaan gramvärjäyksen ja biokemiallisten testien sekä tarvittaessa DNA-sekvenoinnin perusteella kuten B-BaktVi -tutkimuksessa. Sekainfektioissa (7% löydöksistä) PCR-testi tunnistaa luotettavasti ainakin valtakasvuna olevan mikrobin sekä yleensä myös toisen runsaana esiintyvän mikrobin. Mikäli aiheuttajamikrobeja on useampi kuin kaksi, osa löydöksistä voi jäädä PCR-testillä toteamatta.

Päivitetty 23.01.2012 / ET

Sivun alkuun